L'Ospedale di San Giuseppe è nato pochi anni dopo la costruzione di San Bonifacio ed è strettamente legato alle sorti della chiesa anche per le origini dell'edificio. Il nucleo dell'Ospedale di San Giuseppe è l'istituto filiale delle Povere Ancelle di Gesù Cristo (ADJC).

Inizialmente tre, poi sette, le cosiddette Sorelle Dernbach, giunsero a Wiesbaden nel 1856 per ampliare l'assistenza infermieristica ambulatoriale. Grazie ai fondi del Vinzenzverein e a donazioni private, fu acquistato un ex edificio residenziale con un edificio posteriore e un giardino sul terreno della parrocchia cattolica di Friedrichstraße e le suore vi si trasferirono il 1° ottobre 1862. Nello stesso anno, il duca Adolph zu Nassau concesse alle suore i diritti societari e il nome di "Filialinstitut der Armen Dienstmägde Jesu Christi" (Istituto filiale delle Povere Ancelle di Gesù Cristo). Nel 1876, la casa, che era servita temporaneamente come ospedale militare durante la guerra del 1870/71 e poi come scuola, fu convertita in un ospedale per il ricovero dei pazienti.

Nel 1884 fu costruito un nuovo edificio di quattro piani in stile neogotico, l'Hospital zum HeiligenGeist (Ospizio dello Spirito Santo). Ma anche questo edificio divenne presto troppo piccolo; il 15 agosto 1892 fu inaugurato il nuovo Ospedale di San Giuseppe nella sua sede attuale. Da quel momento in poi, i casi chirurgici furono trattati qui e tutti i pazienti con malattie interne furono curati nell'ospizio. Dopo la Prima Guerra Mondiale, durante la quale il St. Josefs-Hospital fu nuovamente utilizzato come ospedale militare, il reparto di ginecologia fu ulteriormente ampliato, con un proprio reparto maternità a partire dal 1925. Le prime infermiere laiche furono assunte nel 1930.

Gravemente danneggiato da una bomba nel febbraio 1945, alla fine degli anni '50 iniziò la progettazione di un nuovo edificio, che fu realizzato nel 1965. L'ospedale St. Josefs disponeva ora di tutte le strutture di un ospedale per acuti che fornisce cure specializzate, motivo per cui il vecchio Hospice zum Heiligen Geist fu demolito nel 1969.

Nel 2002 sono iniziati altri lavori di costruzione e nel 2004 la Clinica Ortopedica di Wiesbaden ha trovato la sua sede nella nuova ala ovest. Nel 2014, l'ultimo convento delle Povere Ancelle di Gesù Cristo è stato dimesso dall'Ospedale San Giuseppe, con conseguente cambiamento della struttura di sponsorizzazione. Da allora lo sponsor è la Fondazione dell'Ospedale San Giuseppe di Wiesbaden, una fondazione di diritto civile.